Офтальмологическое отделение Акмолинской областной больницы организовано в январе 2000 года, после реорганизации Кокчетавской областной офтальмологической больницы (основанной еще в 30-е годы как отделение детской больницы, затем как трахоматозный диспансер). Силами сотрудников офтальмологической больницы ликвидирована трахома в Кокчетавской области. В течение  30 лет оперативное лечение производится на микрохирургическом уровне  с внедрением методики рентгенлокализации и удаления магнитных внутриглазных инородных тел; оперативного лечения: катаракты, глаукомы, косоглазия, близорукости; пластические реконструктивные операции на придатках глаза. Руководили службой опытные офтальмологи Трапезников, Кучерявый Н.И., Аловягин В.И., Борисенко Т.А., Байтышканов А.М. 

   С февраля 2001 года на базе отделения открыт центр «Микрохирургии глаза», который оснащен современным диагностическим и микрохирургическим оборудованием: факоэмульсификатор «Милениум», двухмерный ультразвуковой аппарат, коагулирующий лазер (Германия), автоматический периметр (Япония), бесконтактный тонометр (Япония), портативные офтальмоскопы (США). На базе  центра «Микрохирургии глаза» внедрены новые технологии - лазеркоагуляция сетчатки, лазерная иридо - гониопластика у больных с глаукомой, факоэмульсификация катаракты, рефракционная тоннельная кератобрефопластика. В центре работают опытные офтальмологи, владеющие микрохирургической техникой операций на органе зрения: Маркова Алла Леонидовна, Каримова Рахия Байкеновна, Заяц Галина Сулеймановна, Юнцова Ольга Михайловна, Каирбекова Замзагуль Советовна, Нурканов Берик Ерденович, Волкова Юлия Борисовна, Садибекова Асель Ботаевна. Получено свидетельство на рациональное предложение по лечению высокой близорукости с помощью тоннельной кератобрефопластики (Мошуренко Виктор Васильевич). Маркова Алла  Леонидовна - заведующая отделением, офтальмолог высшей категории, с 1984 году работала в Кокчетавской областной офтальмологической больнице врачом офтальмологом. Прошла подготовку в Праге (Чехия) по внедрению факоэмульсификации катаракты в Казахстане, неоднократно проходила подготовку в Казахском НИИ глазных болезней г. Алматы. Участница  многих международных европейских и республиканских конференций.

    С мая 2014 года назначен заведующим отделения Нурканов Берик Ерденович. Средним и младшим звеном руководит старшая  медицинская сестра Каимова Жанар Сарбаевна, имеющая первую квалификационную категорию, общий стаж работы двадцать три года, в офтальмологии двадцать лет. За проработанное время показала себя как дисциплинированный и исполнительный работник, владеющая   методами исследования и практическими навыками по проведению офтальмологических процедур. Она активно  участвует  в общественной работе  больницы, член  Совета медицинских  сестер,  наставник и пример  для молодых специалистов, неоднократно  проходила  специализации  и  усовершенствования, пользуется доверием и уважением у пациентов и коллег. В штате отделения десять медицинских сестер. Из них одна имеет высшую квалификационную категорию, девять - первую, две медицинские сестры с  высшим  образованием. В 2011 году медсестры Байдусенова Л.А. и Искакова С.Ж. принимали участие в конкурсе, посвященному знанию казахского языка среди лечебных учреждений  г.Кокшетау, где заняли первое призовое место. В 2012 году Байдусенова Л.А участвовала на общебольничном конкурсе «Лучшая медсестра Акмолинской областной больницы», где заняла третье призовое место.